央广网

新闻中心 > 央广网国内 > 地方新闻

央广网

目前最大实验单体型定相全基因组测序成果实现开放共享

2016-10-12 14:32:00 来源:央广网

  央广网深圳10月12日消息(记者郑柱子 通讯员刘旭林)10月11日,华大基因子公司Complete Genomics(CG)与个人基因组计划项目(PGP)共同发布了过百人的实验单体型定相全基因组测序结果,是目前最大的有全面实验确认单体型的高覆盖度全基因组组装。

  “绝大多数现有的基因组数据都没有实验获得的单体型。”CG高级研究主任和项目主导人Brock Peters博士解释道。“这是一组非常独特的数据,会通过开放数据发表方式免费提供给所有人使用。”

  PGP共招募了184人参与这个项目。每个人都同意将他们的身份、基因组及其表型数据免费公开获取。血样由PGP团队收集并送到CG进行DNA分离、LFR(长片段阅读技术)文库生成和全基因组测序。目前已经有114个基因组组装序列可以使用,其余的预计将会在接下来的几个月内公布。

  作为基因组数据发布的一部分,CG和PGP还在开放期刊GigaScience上发表了关于此数据的描述和全面的数据质量分析。

  CG首席科学家Radoje Drmanac博士表示,2011年免费提供了69组全基因组测序数据,这组数据被迅速广泛使用,并成为了遗传学领域的基准和资源。“我们很荣幸能够延续传统,发表这组实验单体型全基因组组装集。这代表了目前可获取的最大最准确的人类单体型。”

  据介绍,早在2012年CG就在Nature上发表过LFR技术,结果显示基因组质量和完整性都非常之高。这次GigaScience上发表的结果也再一次证明LFR的精准性和完整性。每个样品都是以100X的覆盖率进行测序,能够高准确度地检测出大多数变异,且98%以上的杂合变异位于接近1Mb的长组装区域。平均来说,85%以上的单体型不含错误,剩下15%的大部分只含单个定相误差。

编辑:倪艳楠

关键词:基因;实验;数据分析

说两句

相关阅读

秉承红色基因 合力脱贫攻坚(长征路·新故事)

秉承红色基因 合力脱贫攻坚(长征路·新故事),红军过路留佳话,瑶民牢记在心中……”这首龙胜当地老人传唱的山歌,述说的是82年前红军在龙胜的故事。“根据学生住址的远近,龙胜实验中学按照汽车运输公司的票价给每位学生补助交通费,最高补贴35元。

2016-10-06 10:38:00

传承烈士基因,聚合民族复兴的“洪荒之力”

传承烈士基因,聚合民族复兴的“洪荒之力”,烈士纪念日向人民英雄敬献花篮仪式9月30日上午10时在天安门广场隆重举行。”这些为国家和民族牺牲的烈士们堪为中国的脊梁,烈士纪念日来临之际更警示着我们不忘初心、继续前进,为实现国家富强、民族振兴、人民幸福的中国梦砥砺前行。

2016-10-01 13:21:00

弘扬红色传统 传承红色基因

日前,“英雄史诗 不朽丰碑——纪念中国工农红军长征胜利80周年主题展”,在中国人民革命军事博物馆(以下简称军事博物馆)开幕。山东小伙子付强,虽然职业是医生,可他平日里喜欢研究军史、武器装备等,可以说是一个不折不扣的军迷。

2016-09-27 16:04:00

参与讨论

我想说

猜你喜欢

视觉焦点

推荐视频

央广网官方微信

手机央广网

点击排行

违法和不良信息举报电话:010-56807188 新闻热线:4008000088 E-mail:4008000088@cnr.cn
网上传播视听节目许可证号 0102002 京ICP证150508号 京公网安备11040202120007
中央人民广播电台介绍 | 央广网介绍