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中国科学家领衔的科研团队成功绘制出铁皮石斛全基因组图谱

2016-01-12 21:27:00 来源:央广网

  央广网深圳1月12日消息(记者郑柱子 通讯员谢高昌)由中国科学家领衔的科研团队成功绘制出铁皮石斛全基因组图谱,在药用开发研究方面取得阶段性成果,研究成果于1月12日在国际顶级学术杂志Nature(自然)子刊Scientific Reports(科学报告)公开发表。这是世界兰科植物基因组学研究的一个重要成果。

  该科研团队由全国兰科植物种质资源保护中心、深圳市兰科植物保护研究中心刘仲健教授领衔,中国科学院植物研究所、中国台湾成功大学、福建农林大学、比利时根德大学和日本琦玉大学以及清华大学、沈阳药科大学、合肥工业大学和华南农业大学等中外科学家参与。

  铁皮石斛(Dendrobium catenatum)是兰科植物的重要类群,是中国一级重点保护植物,具有重大的观赏、药用价值。铁皮石斛在中国已有2000多年的药用历史,一直以来被誉为中华“九大仙草”之首,它含有多糖、生物碱类等成份,被认为具有抗癌、降血糖、抗忧郁,提高人体免疫力以及治疗老人痴呆症等多种功效。同时铁皮石斛适应性广,能在各种逆境中生长,花朵形态特殊可用于观赏,因此,铁皮石斛具有极高的药用和科研以及生态价值。

  我国铁皮石斛产业近年来快速发展,形成了庞大的产业链,年产值高达300亿元。但在产业发展过程中由于对铁皮石斛的形态分类掌握不准,通常将近缘种误认为是铁皮石斛而造成相互杂交致使种源混杂、伪劣产品充斥市场。这些问题制约了铁皮石斛产业的健康和持续发展。因此,对铁皮石斛全基因组测序将为铁皮石斛活性成份的药物开发、物种保护和品质鉴定促进产业发展提供科学依据。

  科研团队从2010年开始对铁皮石斛全基因组进行测序和开发利用研究。首先他们对采自云南广南、湖南崀山和广东丹霞山的野生铁皮石斛植株进行形态和分子鉴定,确保测序的材料为准确的铁皮石斛。然后提取DNA和RNA进行全基因组测序和分析,高质量地完成了铁皮石斛基因图谱的绘制。结果表明铁皮石斛为二倍体,有38条染色体,基因组大小为1.11Gb。组装的基因组长度为1.01Gb,对应的scaffold N50为391kb, contig N50为33.1kb;发现铁皮石斛有28910个蛋白编码基因。

  该研究发现,铁皮石斛与蝴蝶兰拥有几乎相同的基因数量,但铁皮石斛具有极强应对逆境的能力和防止病原物侵害的免疫能力,可在高温、寒冷、高湿或干旱的环境中生长,形成了能在树上和岩石上附生的特性而分布于温带、亚热带甚至热带的广大地区,从而揭示了其广泛的生态适应性的基因调控机制。

  据介绍,该科研团队在开展铁皮石斛全基因组测序的同时,同步利用测序的分子数据开展了开发利用研究,取得多项成果,包括:开展了铁皮石斛的分子育种,选育出具有效活性成份、栽培容易难以仿冒的优良品种“深兰1号”;制订了全国《石斛质量等级标准》,规范全国石斛产品的标准。

编辑:王家乐

关键词:中国科学家;科研团队;领衔

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