北魏，甘肃境设置8 个州、35个郡、91个县。秦州，治上封（原名上邶，今天水西南），辖天水、略阳（今秦安、天水、清水、静宁县）、汉阳（今天水市一部和成县西北部）3 个郡、1 2 个县；南秦州，治洛谷城（今武都县境），统水南（今西和、礼县和天水市之一部）、汉阳（今礼县东南）、武都（今武都县西北地）、侑城（今康县平洛镇、成县南部和陕西省略阳县西北地）、仇池（今成县西北和西和县部分地方）、武阶（今武都县东南地）6 郡、18县；泾州，治临泾（今镇原县），辖安定（今泾川县北部和平凉市西北部）、陇东（今平凉、镇原等地）、平凉（今华亭、灵台西部）、新平（今泾川县东南、陕西彬县西南、宁夏回族自治区固原附近）、赵平（今灵台县东南、陕西省长武县部分地方）、平原（今平凉市东）6 郡、17县；河州，治包罕（今临夏市东北），辖金城（今临夏东南和榆中县部分地）、武始（今临洮县境）、临洮（今岷县东北、渭源县西南部）、洪和（今临潭县境和临洮县西南部）4 郡、14县；渭州，治襄武（今陇西县西南），统陇西（今陇西县西南）、南安阳（今陇西县东北部）、广宁（今武山、漳县部分地方）3 郡、6 县；原州，治高平（今宁夏回族自治区固原县），领高平（今宁夏回族自治区固原县境）、长城（今平凉市西北部）2 郡、4 县；凉州，治武威（今武威市），统武安（今民勤县西南）、临松（今张掖市和民乐县之一部）、建昌（今榆中西北、临夏北部）、番禾（今永昌县境）、泉城（凉州府境内）、武兴（今武威市西北和北部）、武威（今武威市境）、昌松（今古浪县南部北部和武威市东南部）、东泾（故址不详）、梁宁（今酒泉市境）等郡；瓜州（今敦煌县境）。

　　北周，甘肃境设22州、56郡、104 县。22州是：泾州，治安定（今泾川县北），辖区约当今镇源、灵台、泾川、平凉、华亭县之一部；原州，治平高（今定夏回族自治区固原县），辖区约当今平凉市、会宁和宁夏回族自治区固原地区之一部；宁州，治赵兴郡城（今宁县），辖区约当今庆阳、正宁、宁县、环县之一部；灵州，治薄骨律镇城（今宁夏回族自治区灵武县西南），辖区约当今宁夏平罗、灵武、银川市部分地区；秦州，治上封，辖区约相当于今天水市部分地方和静宁县西南部；交州，治安阳（今秦安县北），辖区约当今秦安县西北部；渭州，治襄武（今陇西县西南），辖区约当今武山、陇西、渭源、漳县之一部；武州，治将利（今武都县东南），辖区约当今武都县东南和文县东北部；成州，治洛谷城（今西和县南洛峪镇），辖区约当今西和、礼县南部；康州，治同谷（今康县嘴台子），辖区约当今康县、成县东南部；文州，治建昌（今文县西南），辖区约当今文县西南部；宕州，治阳宕（今宕昌县西），辖区约当今宕昌西部和舟曲县西北部；芳州，治封德（今迭部县东南），辖区约当今迭部县东南部；叠州，治叠川（今迭部县江洪滩附近之巴什旦卡），辖区约当今迭部县之一部；洮州，治美相（今临潭县），辖区约当今临潭和卓尼县之一部；岷州，治溢乐（今岷县），辖区约当今临洮西南、岷县北部、卓尼县东北部；旭州，治合城（今碌曲县东），辖区约当今碌曲县东部；弘州，治广川防（今碌曲县西南），辖区约当今碌曲县西南部；河州，治包罕（今临夏市），辖区约当今临夏大部、兰州西部和临洮县之一部；凉州，治姑臧（今武威市），辖区约当今民勤东北、武威、永登东南、永昌西部；甘州，治永平（今张掖市西北），辖区约当今张掖、山丹、民乐、酒泉、高台之一部；瓜州，治鸣沙（今敦煌县东南），辖区约当今敦煌、安西、玉门市之一部。

 隋唐五代时期

　　到隋唐五代，又回到秦汉的郡县两级制。

　　隋初，隋文帝为改变南北朝时期州、郡、县三级体制过于分散的状况，根据“存要去闲，并小为大”的原则，开皇三年（公元583 年）裁并州郡，取消郡一级建制，实行以州统县，使东汉末年以来实行的三级地方政制，重新恢复为州、县两级制。隋炀帝大业三年（公元607 年），又改州为郡，以郡统县，并分郡为上、中、下三等。另设司隶和刺史分部巡察，主掌监察。经裁并，省境共设16郡、76县。