5月20日,传染病预防控制国家重点实验室公众号刊登一篇题为《新冠肺炎重症患者鼻咽部过度生长的“超级优势致病性共生菌属”可下行到肺部致病》的文章,称研究发现SARS-CoV-2重症患者的鼻咽微生物群多样性丧失,且增长占比超过50%的鼻咽部细菌——超级优势菌(Super-dominant Pathobiontic Bacteria,SDPG),可在疾病发展进程中侵入下呼吸道,导致患者出现继发性细菌性肺炎。

文章指出,若要减少新冠患者的重症率和死亡率,要考虑超级优势菌的存在,并关注鼻咽部菌群失调问题。

中国医学科学院学部委员、中国工程院院士、南开大学公共卫生与健康研究院院长、中国微生物学会理事长、传染病预防控制专家徐建国向媒体表示,过度生长的致病共生菌往往对多种抗生素耐药,给治疗带来困难,是重症和死亡的重要原因。“许多病毒性传染病是始于病毒‘亡’于细菌,譬如甲流,我们对这一点忽略了。”

该文章援引的研究论文近期发表于《Spectrum Microbiology》杂志,题为《鼻咽部微生物群中的超级优势病原菌导致COVID-19患者二次细菌感染(Super Dominant Pathobiontic Bacteria in the Nasopharyngeal Microbiota Cause Secondary Bacterial Infection in COVID-19 Patients)》。第一作者为中国疾病预防控制中心传染病所研究员秦天,传染病所徐建国院士为责任作者。

健康人的鼻咽部包括两类细菌,一类是健康共生菌,一类是致病共生菌。致病共生菌在正常情况下和人共生,但具有致病潜力;在宿主免疫力低下等条件下,可导致疾病发生,也称“两面菌(two face bacteria)”。

超级优势致病性共生菌属(SDPG),指在流感病毒患者鼻咽部的致病共生菌(Pathobionts)过度增长,丰度(数量)占比超过菌群细胞总数50%的致病性菌属。

该研究团队对20例重症和51例轻症新冠患者开展上下呼吸道细菌宏分类学研究后发现,新冠肺炎轻度和重度患者的SDPG数量存在显著差异。在轻症患者中,10.8%的鼻咽部菌群和8.5%下呼吸道菌群有SDPG,没有患者在这两个区域同时出现SDPG。而在重症患者中,40.7%的鼻咽部菌群和63.2%的下呼吸道菌群有SDPG,其中30%重症患者,从鼻咽拭子和肺泡灌洗液标本分离菌株的基因组序列完全一致,这说明这些超级优势致病共生菌可在疾病发展进程中,从鼻咽部下行到肺泡造成感染,导致重症或者死亡。

在新冠肺炎患者中发现具有下行能力的细菌包括,鲍曼不动杆菌、金黄色葡萄球菌、纹状体棒状杆菌等。其中,葡萄球菌、棒状杆菌和不动杆菌是主要的SDPG。

对此,该研究认为,SARS-CoV-2重症患者的鼻咽微生物群多样性丧失,鼻咽微生物群中的SDPG可导致新冠重症患者出现继发性细菌感染,并加重肺炎,导致高死亡率。事实上,继发性细菌感染,是目前病毒性肺炎(例如流感)重症化,乃至导致死亡的最重要、最直接的原因之一。

澎湃新闻记者注意到,徐建国团队也曾发表相关针对继发性下呼吸道细菌感染的研究论文,提出超级优势菌可在疾病发展进程中下行到肺泡造成感染,导致死亡。

该论文题为“鼻咽部超级优势菌是流感患者继发细菌感染的原因(Super-dominant Pathobiontic Bacteria in the Nasopharyngeal Microbiota as Causative Agents of Secondary Bacterial Infection in Influenza Patients)”,于2020年发表于期刊杂志《Emerging Microbes & Infections》。第一作者为中国疾病预防控制中心传染病所研究员秦天,协和医院李太生主任、传染病所徐建国院士为责任作者。

为了证实鼻咽部超级优势菌可下行到肺泡的理论,该研究团队基于2017-2018年北京流感大流行期间的样本开展对照试验,利用16SrRNA基因V3-V4区域的高通量测序分析鼻咽部微生物群的分类组成。

研究人员从患者的咽拭子和肺泡灌洗液分离细菌后发现,61% 的重症患者、24%的轻症患者和29%健康人鼻咽部菌群具有SDPG。

同一患者,从鼻咽部和肺泡分离的菌株的基因组序列完全一致。也就是说,患者鼻咽部的超级优势致病性共生菌属可下行到肺泡,造成肺部感染。研究发现具有下行能力的细菌包括鲍曼不动杆菌、肺炎克雷伯菌、铜绿假单胞菌、纹状体棒状杆菌等。

该论文题为“鼻咽部超级优势菌是流感患者继发细菌感染的原因(Super-dominant Pathobiontic Bacteria in the Nasopharyngeal Microbiota as Causative Agents of Secondary Bacterial Infection in Influenza Patients)”,于2020年发表于期刊杂志《Emerging Microbes & Infections》。第一作者为中国疾病预防控制中心传染病所研究员秦天,协和医院李太生主任、传染病所徐建国院士为责任作者。

为了证实鼻咽部超级优势菌可下行到肺泡的理论,该研究团队基于2017-2018年北京流感大流行期间的样本开展对照试验,利用16SrRNA基因V3-V4区域的高通量测序分析鼻咽部微生物群的分类组成。

研究人员从患者的咽拭子和肺泡灌洗液分离细菌后发现,61% 的重症患者、24%的轻症患者和29%健康人鼻咽部菌群具有SDPG。

同一患者,从鼻咽部和肺泡分离的菌株的基因组序列完全一致。也就是说,患者鼻咽部的超级优势致病性共生菌属可下行到肺泡,造成肺部感染。研究发现具有下行能力的细菌包括鲍曼不动杆菌、肺炎克雷伯菌、铜绿假单胞菌、纹状体棒状杆菌等。

(来源:澎湃新闻)

编辑:刘梦羽
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